È possibile definire delle aree di confronto per il paragone tra due elementi visualizzabili di PCB o tra due elementi visualizzabili di schema dello stesso progetto. È possibile definire una o più aree rettangolari da confrontare. Le aree di confronto vengono visualizzate in tutte le viste di entrambi i progetti; inoltre, le aree di confronto non possono sovrapporsi. Vengono messi a confronto solo gli elementi all'interno dell'area di confronto definita e gli oggetti i cui limiti intersecano i limiti dell'area. Non è possibile modificare un'area di confronto definita. È invece possibile eliminarne una e definirne un'altra.