Nel sistema di preferenze di Windchill, a cui si accede selezionando Gestione preferenze > Operazione > Gestione dati CAD > Gestione del contenuto > Contrassegna come obsoleto, vengono elencate le categorie di contenuto secondario per il sito. Per ogni categoria di tipo di file, se si imposta la preferenza Contrassegna come obsoleto su Sì (il valore di default è No), durante l'esecuzione di varie operazioni PDM tutto il contenuto secondario del tipo di categoria specificato viene contrassegnato come obsoleto, ad esempio nella tabella Allegati della pagina delle informazioni del documento CAD. Se si imposta il valore su No, la categoria non viene contrassegnata come obsoleta perché viene trasferita insieme al documento CAD.

È possibile ignorare manualmente i conflitti determinati da file obsoleti, ad esempio durante un tentativo di Check-In, nel modo seguente descritto di seguito.