另一种需要特别注意的情况是必须从不同的变型应用两个更改包的情况。除非使用了正确程序，否则“重新同步更改包”会由于需要太多合并操作而失败。

例如，主项目包含修订版本 1.4 的文件 patch.c。构建管理员使用的变型项目包含将针对项目修补程序首次发布的修复（patch.c、修订版本 1.2.1.2、更改包 9:1）。维护开发团队的变型项目还包括针对修订版本 1.3.1.2 的 patch.c 的错误修复，而且此修订版本与更改包 10:1 关联。主项目需要这两个修复。

只有两种方式能够不受限制地顺利完成先前的情景：手动处理，或者执行“重新同步更改包”和“应用更改包”两次（每个更改包一次），以检入每次操作后默认最新修订版本上的合并更改。