示例：主分量分析 2
使用函数 Nipals 和 Nipals2 分析复数数据，例如，分析含有五种不同药剂有效成分的药片的近红外 (NIR) 光谱 (数据由 Bruker Optics, Inc. 提供)。可以创建根据光谱区分每种药剂的模型，即使实际的药剂是未知的。此模型可用于在生产更多药片时进行质量控制。
1. 定义下列数据集：
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该数据集描述了临床试验中的双盲研究。
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第一列是波数 (1/波长)，单位为 cm-1。每种药剂有五个连续光谱，构成了其余的 25 列。
最大值位于数据矩阵中第 210 行和第 17 列。
4. 绘制每种药剂的两个光谱，共 10 个数据集。数据集对位于 Data 矩阵的 [1,2]、[6,7]、[11,12]、[16,17] 和 [21,22] 列。
◦ 要获得水平轴的合理比例，请将波数除以 1000。类似地，由于光谱值小，因此将其乘以 1000。
◦ 使用水平标记显示最大光谱值。
◦ 按照约定，以降序绘制波数图像。因此，Data<0> 无法以正确的顺序显示波数。
◦ 光谱中无任何部分可用于轻松区分各种药剂：它们具有相同的基本形式和相近的吸光率值。
◦ 大部分数据是多余的。每个光谱中有 236 个点，表示 236 个被测量 (对特定波长光的吸光率)，但是这些点的变化之间是明显相关的。
5. 将矩阵 Data 分割成两个数据集：波数 (第 0 列) 和每个药片的光谱 (子矩阵 S)。要符合常规约定，可转置每个药片的光谱数据集，以使每一列对应一个自变量。
7. 选取要重新构建的光谱。
8. 从 Nipals 函数的输出中提取分数和输入。
9. 使用均值函数计算平均光谱值。
10. 通过将输入矢量矩阵与分数矩阵相乘，然后加上平均光谱值，来估算原始光谱值。
11. 绘制原始光谱和重新构建的光谱的图象。缩放水平和竖直轴，以获得合理的值。
对于主分量分析，仅使用两个主分量就可以很好地表示所有光谱。
12. 将分数重新排列为两个矩阵。矩阵的每列表示五种药片药剂中其中一种的分数。
13. 根据第二个因子的分数绘制第一个因子的分数。每种药剂均以不同的颜色显示。
数据的某些分组明显，但仍难以区分各种药剂。向绘图中添加第三个分数可能会有帮助。
14. 使用 Nipals2 函数将四个主分量添加到由两个主分量创建的模型中。
NIPALS2 的输出矩阵的形式与 NIPALS 的输出矩阵的形式相同，但是带有与附加主分量对应的附加列和行。此时，分数和输入的数量增加至 6 个。
15. 从矩阵 NIPALS2 中提取输入和分数，以创建所选光谱的新模型。
16. 绘制所选光谱的两个模型的图象并进行比较。缩放水平和竖直轴，以获得合理的值。
17. 从 NIPALS2 提取累积方差。
18. 根据主分量的数量绘制累积方差图像。
尽管前两个主分量 (PC) 表示了方差的 99%，但第三个 PC 才是按药剂对数据进行分组的关键。主分量分析将数据压缩为最主要的因子，而非最相关的因子。