物種模組的邊界條件參數會套用至 Flow Analysis 樹中的邊界。在 Flow Analysis 樹中的「一般邊界」(General Boundaries) 底下選取某個邊界時，系統會在內容面板中顯示邊界條件。

對於使用者定義的物種或純量，當其法向邊界梯度為零或可忽略時，會使用「零通量」邊界條件。對於流體區域或體積，零通量是壁曲面上的預設物種邊界條件。

對稱意味著會將零通量或零梯度條件自動套用至物種。物種的「對稱」(Symmetry) 邊界條件通常對應於模型中的物理對稱。

指定的值適用於物種值為已知數量的邊界條件，該值可以是常數，也可以是您在運算式編輯器中定義的函數。當您將流動邊界條件設定為「指定的速度」、「指定的體積通量」、「指定的總壓力」或「指定的壓力入口」時，指定的值邊界條件通常對應於模型中的物理入口邊界。

對於物種流動預期會離開領域的開口，可在此開口處使用「出口」邊界條件。將流動邊界條件設定為「指定的壓力出口」或「電阻電容」時，此邊界條件通常對應於物理出口邊界。預設條件為零通量。如果物種進入邊界的領域，則適合使用指定的值。

對流通量適用於已知物種「交換係數」與「環境值 (濃度)」邊界的情況。

已知單位面積通量 (常數或使用運算式編輯器給定的函數) 時，可使用「指定的通量」邊界條件來指定單位面積上的通量。通量的方向由下列其中一個選項設定：

「指定的總通量」邊界條件可用於設定跨邊界的物種的總通量。單位面積上的通量由求解器確定，然後即可與「指定的通量」條件使用相同的方式進行處理。

當且僅當介面一側的體積塊已針對物種進行遮蔽時，物種模組的介面屬性與邊界條件相同。如果物種模組在介面兩側都處於使用中狀態，則此介面上不需要邊界條件。