A programação de sub-rotina permite a criação de sequências NC, colocá-las como macros no começo do arquivo CL e chamá-las a partir do corpo principal do arquivo CL várias vezes, conforme necessário. Este aprimoramento diminui o tamanho de arquivos CL, tornando mais fácil para o controlador gerenciá-los e para o programador ler e editá-los. Os aplicativos típicos incluem trabalho de lápide, instalação de várias peças em uma paleta e impulsores de turbina em que as palhetas sejam as mesmas.